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基于GM(1,1)模型的蛋白质二级结构类型预测
作者: LIN Wei-zhong   肖绚   来源: 计算机工程与应用 年份: 2007 文献类型 : 期刊 关键词: 二级结构型预测   1)模型   蛋白质   GM(1  
描述: 蛋白质二级结构类型预测是当今生物信息学研究的热点之一。利用氨基酸数字编码模型将氨基酸序列转换成数字信号,得出此蛋白质的GM(1,1)模型参数,并将这些参数作为伪氨基酸成分,由于这些伪氨基酸成分具有描述氨基酸序列的总体特征的特点,使得预测成功率有较大的提高。
基于OET-KNN算法的蛋白质二级结构类型预测
作者: 邱望仁   肖绚   林卫中   来源: 计算机工程与应用 年份: 2008 文献类型 : 期刊 关键词: 二级结构型预测   近邻算法   K   蛋白质  
描述: 蛋白质二级结构类型预测是当今生物信息学研究的热点之一。利用氨基酸数字编码模型将氨基酸序列转换成数字信号,根据LZ复杂度的算法计算了氨基酸的伪氨基酸成分,再对伪氨基酸成分用OET-KNN算法进行分类预测。Jackknife测试结果表明该算法能使得预测成功率有较大的提高。
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