基于OET-KNN算法的蛋白质二级结构类型预测

【类型】期刊

【作者】邱望仁 肖绚 林卫中 

【刊名】计算机工程与应用

【关键词】 二级结构型预测 近邻算法 K 蛋白质

【资助项】国家自然科学基金No.60661003 江西省自然科学基金No.0611060 江西省青年科学家(井冈之星)培养计划资助~~

【摘要】蛋白质二级结构类型预测是当今生物信息学研究的热点之一。利用氨基酸数字编码模型将氨基酸序列转换成数字信号,根据LZ复杂度的算法计算了氨基酸的伪氨基酸成分,再对伪氨基酸成分用OET-KNN算法进行分类预测。Jackknife测试结果表明该算法能使得预测成功率有较大的提高。

【年份】2008

【期号】第29期

【页码】204-206，210

【作者单位】景德镇陶瓷学院信息工程学院

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