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基于蛋白质哈斯矩阵图的分泌蛋白预测
作者: 肖绚   徐培杰   来源: 计算机工程与应用 年份: 2011 文献类型 : 期刊 关键词: 哈斯矩阵   Jackknife测试   分泌蛋白   模糊K近邻算法  
描述: 因为研究分泌蛋白质有助于找到直接与特定生理或病理状态相关的生物分子,判断一条未知蛋白是否为分泌蛋白是非常重要的。基于同一类型蛋白质的哈斯矩阵图具有相似图像纹理假设,提取图像的几何矩作为伪氨基酸成分对未知蛋白质序列是否属于分泌蛋白进行预测,采用Jackknife算法进行测试,预测成功率与现有算法相比有很大的提高。
哈斯矩阵图的G-蛋白偶联受体类型预测
作者: 肖绚   徐培杰   来源: 计算机工程 年份: 2011 文献类型 : 期刊 关键词: 生物信息学   哈斯矩阵   G   Jackknife测试   模糊K近邻算法   蛋白偶联受体  
描述: 利用氨基酸数字编码模型,将蛋白质序列转换为数字序列,根据偏序理论构建蛋白质哈斯矩阵。基于同一类型蛋白质哈斯矩阵图具有相似图像纹理的假设,运用图像处理方法提取图像的几何矩作为伪氨基酸成分,对G-蛋白偶联受体类型分为2层进行预测,预测成功率分别为92.33%和85.48%。预测效果表明该方法是可行的。
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