元胞自动机图的蛋白质二级结构类型预测

【类型】期刊

【作者】胡鸿豪 宋丽平 肖绚 

【刊名】计算机工程与应用

【关键词】 蛋白质二级结构 灰度共生矩阵 元胞自动机 Jackknife测试 K近邻算法

【资助项】国家自然科学基金　　（No.60661001）；江西省自然科学基金　　（No.0611060）

【摘要】蛋白质结构预测是后基因组时代的一项重要任务,蛋白质二级结构预测是蛋白质结构预测的关键步骤.利用氨基酸数字编码模型生成蛋白质序列的元胞自动机图(Cellular Automata Image,CAI),提出了一种基于灰度共生矩阵(Gray Level Co-occurrence Matrix,GLCM)提取纹理图像特征的方法.用扩大的协方差算法进行预测,仿真结果显示有较好的分类效果,Jackknife检验的预测成功率达到94.61%.

【年份】2010

【期号】第15期

【作者单位】景德镇陶瓷学院机电学院

【全文挂接】获取全文