一种新的蛋白质亚细胞定位预测方法

【类型】期刊

【作者】程昔恩 吴志诚 

【刊名】计算机工程与应用

【关键词】 Gene Ontology 蛋白质亚细胞定位 多标记学习 最近邻算法

【资助项】国家自然科学基金；江西省自然科学基金

【摘要】蛋白质亚细胞定位是蛋白质组学基本问题之一.某些类型蛋白质可能存在于两个或两个以上的亚细胞位置,这类蛋白质的亚细胞定位问题更为复杂.分别利用Gene Ontology和伪氨基酸成分法,将一条蛋白质表示为一实值向量；采纳多标记学习中的Ranking思想,计算出一得分向量V,该向量的每一分量的值表示被预测蛋白质属于某个亚细胞位置的概率；利用最近邻算法预测蛋白质所属亚细胞位置的个数n,得分向量V中得分最高的n个分量对应的亚细胞位置即为预测的位置.

【年份】2012

【期号】第6期

【作者单位】景德镇陶瓷学院信息工程学院

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